Mae risgiau cymdeithasegol hefyd o ran defnyddio nanotechnoleg. Ar lefel offerynnau, mae hefyd yn cynnwys y posibilrwydd o ddefnyddio nanotechnoleg yn y maes milwrol. (Er enghraifft, yn Sefydliad Nanotechnoleg MIT Soldiser [1], astudir y mewnblaniadau neu ddulliau eraill o arfogi milwyr, yn ogystal â dulliau gwyliadwriaeth a wellwyd gan nanodetectors.
Ar y lefel strwythurol, mae beirniaid nanotechnoleg yn tynnu sylw at y ffaith bod nanotechnoleg wedi agor byd newydd a reolir gan hawliau eiddo a chwmnïau. Gwnaethant dynnu sylw at y ffaith, yn union fel y mae gallu biotechnoleg i drin genynnau yn cyd-fynd â patentau bywyd, fod technoleg nanotechnoleg i drin moleciwlau yn arwain at batentau sylweddau. Yn ystod yr ychydig flynyddoedd diwethaf, mae cael patentau nanoscale wedi bod fel rhuthr aur. Yn 2003, cymeradwywyd dros 800 o hawliau patentau sy'n gysylltiedig â nanometer, ac mae'r nifer hwn yn cynyddu bob blwyddyn. Mae cwmnïau mawr wedi monoboli ystod eang o batentau ar gyfer dyfeisiadau a darganfyddiadau nanoscale. Er enghraifft, mae dau gwmni mawr, NEC ac IBM, yn dal patentau sylfaenol ar gyfer nanodiwbiau carbon, un o gonglfeini nanotechnoleg. Mae gan nanodiwbiau carbon ystod eang o gymwysiadau a disgwylir iddynt chwarae rhan allweddol mewn llawer o feysydd diwydiannol yn amrywio o electroneg a chyfrifiaduron, i gryfhau deunyddiau, i ryddhau cyffuriau a diagnosis. Nanodiwbiau carbon sy'n debygol o ddod yn brif ddeunyddiau masnachu diwydiannol sy'n disodli deunyddiau crai traddodiadol. Fodd bynnag, pan fydd eu defnydd yn ehangu, rhaid i unrhyw un sydd am weithgynhyrchu neu werthu nanodiwbiau carbon, waeth beth fo'r cais, brynu trwydded gan NEC neu IBM yn gyntaf.