Trawsnewidiodd gwyddonydd naturiol Prydain John Dalton ddamcaniaeth atomig hapfasnachol Groeg hynafol yn ddamcaniaeth gemegol feintiol a cynigiodd fodel damcaniaethol cyntaf y byd o'r atom. Mae gan ei ddamcaniaeth y pedwar pwynt canlynol yn bennaf:
(1) Mae pob mater yn cynnwys gronynnau bach iawn, anweledig, sef atomau.
(2)Mae gwahanol briodweddau a mygydau atomau'r un elfen yr un fath, ac amlygir atomau gwahanol elfennau yn bennaf mewn gwahanol fasau.
(3)Mae atomau yn sfferau solet bach, anweledig.
(4) Atomau yw'r uned leiaf sy'n cymryd rhan mewn newidiadau cemegol. Mewn adweithiau cemegol, dim ond ad-drefnu y caiff atomau eu had-drefnu ac ni fyddant yn cael eu creu na'u diflannu.
Er y cadarnhawyd gan genedlaethau diweddarach fod hwn yn fodel damcaniaethol aflwyddiannus, daeth Dalton ag atomau o athroniaeth i gemeg am y tro cyntaf, gan egluro cyfeiriad ymdrechion fferyllwyr yn y dyfodol, a bod cemeg wedi esblygu'n wirioneddol o alchemy hynafol. Ar ôl cael gwared arno, cafodd Dalton ei alw'n "dad cemeg fodern" gan genedlaethau diweddarach.